Cosa succede in Koukaku Kidoutai S.A.C. 2nd GIG?
Sezione I migliori membri della sezione 9, Motoko Kusanagi, Batou e Togusa, continuano ad avere avventure. Il concetto di intera serie è stato creato dalle idee di Mamoru. La sezione 9 si occupa di questioni politiche come i rifugiati invitati e l'intrigo nucleare ed è rappresentato nella serie. .